Małopolski Fundusz Ekonomii Społecznej jako nadrzędne stawia sobie następujące cele:
- rozwój przedsiębiorczości społecznej,
- inspirowanie i wspomaganie tworzenia przedsiębiorstw społecznych,
- współpracę z samorządem terytorialnym i administracją rządową w zakresie wspierania rozwoju przedsiębiorczości społecznej.
MFES realizuje swoje cele poprzez udzielanie pożyczek i poręczeń oraz świadczenie pomocy doradczej w uruchamianiu działalności gospodarczej. Naszym priorytetem są inicjatywy tworzone przez studentów i absolwentów szkół wyższych.